Экспозиция Шебекинского музея состоит из пяти залов общей площадью около 400 кв. метров. Она отражает основные исторические события, происходившие на территории района с древнейших времен до современности, а также представляет вниманию посетителей произведения искусства из фондовых коллекций ШИХМ.
Исторические разделы экспозиции повествуют о каменном веке на территории района, развитии края в эпоху бронзы и раннего железного века, о появлении на землях племен салтово-маяцкой культуры, первых древнерусских поселениях и их судьбе, о строительстве Белгородской оборонительной черты и основании Шебекино. Значительный материал и интереснейшие экспонаты представлены в двух залах военной истории.
Картинная галерея Шебекинского музея включает шедевры Репина, Фалька, Соломина, Соколова-Скаля, Лаптева, Тружанского, Косминой и многих других выдающихся отечественных живописцев.